سنتز پروب با برچسب گذاری انتهایی 3 شامل افزودن نوکلئوتیدها به انتهای 3 پریم هر یک از DNA است. برچسبگذاری انتهایی DNA 3 اغلب توسط ترانسفراز پایانی کاتالیز میشود. مولکول های DNA تک رشته ای و دو رشته ای با افزودن dNTP به انتهای آن ها 3′-OH نشاندار می شوند. در توضیح کاملتر باید گفت که بسیاری از ابزارهای تشخیصی یا سنجش های جدید مبتنی بر اسید نوکلئیک توسعه یافته اند که امکان تجزیه و تحلیل مولکول های DNA و RNA را در نمونه های بالینی را فراهم می کند . این سنجش ها در حال حاضر به طور معمول برای نظارت یا تشخیص، و همچنین برای کمک به تصمیم گیری در مورد بهترین درمان برای بیماران استفاده می شود و پروب ها و پرایمرهای خاصی برای این منظور طراحی شده اند. پروب های ژن در تکنیک های مختلف بلات و هیبریداسیون درجا (ISH) برای تشخیص توالی های اسید نوکلئیک در صنایع غذایی، کاربردهای زیست محیطی، پزشکی و دامپزشکی برای بهبود ویژگی آنالیزها استفاده می شود. در پزشکی، آنها می توانند در شناسایی میکروارگانیسم ها و تشخیص بیماری های عفونی، ارثی و غیره کمک کنند. در عمل DNA های دو و تک رشته ای که شامل mRNA ها و سایر RNA های سنتز شده در شرایط آزمایشگاهی ؛ همگی به عنوان پروب استفاده می شوند.